Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 GUP1YGL084C 1683 nt5.69□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 EMP70YLR083C 2004 nt5.69□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 RRT13YER066W 558 nt5.69□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 HTB2YBL002W 396 nt5.69□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 YPR136CYPR136C 513 nt5.69□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 SOF1YLL011W 1470 nt5.69□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 LEU1YGL009C 2340 nt5.69□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 MCX1YBR227C 1563 nt5.68□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 LDS2YOL047C 1071 nt5.68□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 CBF5YLR175W 1452 nt5.68□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 SEC6YIL068C 2418 nt5.68□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 SRC1YML034W 2505 nt5.68□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 RIP1YEL024W 648 nt5.67□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 ECM34YHL043W 513 nt5.67□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 BAT1YHR208W 1182 nt5.67□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 URM1YIL008W 300 nt5.67□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt5.67□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt5.67□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 GLT1YDL171C 6438 nt5.67□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 LCB4YOR171C 1875 nt5.66□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 CPS1YJL172W 1731 nt5.66□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 RPC11YDR045C 333 nt5.66□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt5.66□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 NOP53YPL146C 1368 nt5.66□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 GSY1YFR015C 2127 nt5.65□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 HTA1YDR225W 399 nt5.65□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt5.65□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 CSR1YLR380W 1227 nt5.65□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.65□□□□□ -1.5
MSB4Q12317 SNF3YDL194W 2655 nt5.65□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 FPK1YNR047W 2682 nt5.65□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YDL199CYDL199C 2064 nt5.65□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 APL6YGR261C 2430 nt5.65□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 IMA1YGR287C 1770 nt5.65□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 GDH2YDL215C 3279 nt5.65□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 CDC26YFR036W 375 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 RPL28YGL103W 450 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 ECT1YGR007W 972 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 ILV5YLR355C 1188 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 DNF2YDR093W 4839 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YJL206CYJL206C 2277 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 SNX41YDR425W 1878 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 ELP2YGR200C 2367 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 HDA2YDR295C 2025 nt5.64□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YCK2YNL154C 1641 nt5.63□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 RIM13YMR154C 2184 nt5.63□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 TDA5YLR426W 981 nt5.63□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt5.63□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 ATP15YPL271W 189 nt5.63□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 MSR1YHR091C 1932 nt5.63□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 TPA1YER049W 1935 nt5.62□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 SAP155YFR040W 3009 nt5.62□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 snR61snR61 90 nt5.62□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YDR426CYDR426C 378 nt5.62□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 RPS21BYJL136C 264 nt5.62□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 PCC1YKR095W-A 267 nt5.62□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YML037CYML037C 1023 nt5.62□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 EXO1YOR033C 2109 nt5.62□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 ABF1YKL112W 2196 nt5.62□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 ARX1YDR101C 1782 nt5.61□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 DAD4YDR320C-A 219 nt5.61□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 MZM1YDR493W 372 nt5.61□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 GPP2YER062C 753 nt5.61□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 RPL14BYHL001W 417 nt5.61□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 RDN58-1RDN58-1 158 nt5.61□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 RDN58-2RDN58-2 158 nt5.61□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt5.61□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YMR196WYMR196W 3267 nt5.61□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YKL100CYKL100C 1764 nt5.6□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 APC1YNL172W 5247 nt5.6□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YER158CYER158C 1722 nt5.6□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YNL193WYNL193W 1677 nt5.6□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 ASG1YIL130W 2895 nt5.6□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 RPS4AYJR145C 786 nt5.6□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YLR346CYLR346C 306 nt5.6□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 EGD1YPL037C 474 nt5.6□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 CTM1YHR109W 1758 nt5.6□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 YDR061WYDR061W 1620 nt5.59□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 DSL1YNL258C 2265 nt5.59□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 TUP1YCR084C 2142 nt5.59□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 AUA1YFL010W-A 285 nt5.59□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 UPS1YLR193C 528 nt5.59□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 snR17bsnR17b 332 nt5.59□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 PIS1YPR113W 663 nt5.59□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 SUM1YDR310C 3189 nt5.59□□□□□ -1.51
MSB4Q12317 MSC2YDR205W 2175 nt5.58□□□□□ -1.52
MSB4Q12317 KEX1YGL203C 2190 nt5.58□□□□□ -1.52
MSB4Q12317 TRX3YCR083W 384 nt5.58□□□□□ -1.52
MSB4Q12317 RPL14AYKL006W 417 nt5.58□□□□□ -1.52
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