Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPN11Q06124 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN11Q06124 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms