Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE1BQ01064 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms