Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDLBPQ00341 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms