Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX3P78415 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX3P78415 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX3P78415 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX3P78415 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX3P78415 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX3P78415 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX3P78415 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX3P78415 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX3P78415 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX3P78415 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX3P78415 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX3P78415 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX3P78415 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX3P78415 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX3P78415 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX3P78415 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX3P78415 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX3P78415 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX3P78415 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX3P78415 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX3P78415 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX3P78415 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX3P78415 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX3P78415 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX3P78415 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX3P78415 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX3P78415 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX3P78415 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX3P78415 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX3P78415 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX3P78415 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX3P78415 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX3P78415 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms