Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVS71-1P61550 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms