Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL3P58215 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms