Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTBP2P56545 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTBP2P56545 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms