Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN5P54829 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN5P54829 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms