Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA4P52798 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms