Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2A2P52657 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2A2P52657 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms