Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCR4P51679 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCR4P51679 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCR4P51679 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCR4P51679 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCR4P51679 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCR4P51679 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCR4P51679 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCR4P51679 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCR4P51679 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCR4P51679 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCR4P51679 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCR4P51679 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCR4P51679 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCR4P51679 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCR4P51679 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCR4P51679 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCR4P51679 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCR4P51679 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCR4P51679 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCR4P51679 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCR4P51679 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCR4P51679 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCR4P51679 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCR4P51679 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCR4P51679 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms