Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRCA2P51587 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRCA2P51587 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms