Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTTP42858 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTTP42858 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTTP42858 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTTP42858 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTTP42858 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTTP42858 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTTP42858 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTTP42858 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HTTP42858 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTTP42858 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTTP42858 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTTP42858 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTTP42858 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTTP42858 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTTP42858 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTTP42858 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTTP42858 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTTP42858 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTTP42858 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTTP42858 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTTP42858 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTTP42858 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTTP42858 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTTP42858 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTTP42858 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTTP42858 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTTP42858 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTTP42858 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTTP42858 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTTP42858 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTTP42858 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTTP42858 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HTTP42858 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTTP42858 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTTP42858 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTTP42858 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTTP42858 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTTP42858 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTTP42858 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTTP42858 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTTP42858 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTTP42858 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTTP42858 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTTP42858 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTTP42858 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTTP42858 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTTP42858 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTTP42858 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTTP42858 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTTP42858 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTTP42858 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTTP42858 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTTP42858 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTTP42858 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTTP42858 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTTP42858 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTTP42858 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms