Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIA2P42262 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA2P42262 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA2P42262 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA2P42262 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA2P42262 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms