Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTRLP40313 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRLP40313 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRLP40313 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms