Protein–RNA interactions for Protein: P38996

NAB3, Nuclear polyadenylated RNA-binding protein 3, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 802 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NAB3	P38996	REC8	YPR007C	2043 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	PHO2	YDL106C	1680 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	INP53	YOR109W	3324 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	YLR001C	YLR001C	2589 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	YGR242W	YGR242W	309 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	YGR293C	YGR293C	462 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	YJL086C	YJL086C	369 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	PET191	YJR034W	327 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	YMR187C	YMR187C	1296 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	NAB3	YPL190C	2409 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	PSK2	YOL045W	3306 nt		2.98	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	DAD1	YDR016C	285 nt		2.97	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	SDC1	YDR469W	528 nt		2.97	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	FMP32	YFL046W	624 nt		2.97	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	YGL109W	YGL109W	324 nt		2.97	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		2.97	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	RPL25	YOL127W	429 nt		2.97	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	YPR145C-A	YPR145C-A	237 nt		2.97	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	ARR2	YPR200C	393 nt		2.97	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	EDS1	YBR033W	2760 nt		2.97	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	SNF12	YNR023W	1701 nt		2.96	□□□□□ -1.93
NAB3	P38996	PRE1	YER012W	597 nt		2.96	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	YNR021W	YNR021W	1215 nt		2.96	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	GRX5	YPL059W	453 nt		2.96	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	YPR089W	YPR089W	2667 nt		2.96	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	SHQ1	YIL104C	1524 nt		2.96	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	SAK1	YER129W	3429 nt		2.96	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	15S_rRNA	15S_rRNA	1649 nt		2.96	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	CHS2	YBR038W	2892 nt		2.96	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	PSO2	YMR137C	1986 nt		2.96	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	NUP100	YKL068W	2880 nt		2.95	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	EXO5	YBR163W	1758 nt		2.95	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	PAU8	YAL068C	363 nt		2.95	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	PAU23	YLR037C	375 nt		2.95	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	GOT1	YMR292W	417 nt		2.95	□□□□□ -1.94	RIP-Chip
NAB3	P38996	YNL046W	YNL046W	519 nt		2.95	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	PAU20	YOL161C	363 nt		2.95	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		2.95	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	YOR169C	YOR169C	465 nt		2.95	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	TRM7	YBR061C	933 nt		2.95	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	YNR063W	YNR063W	1824 nt		2.95	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	KAR9	YPL269W	1935 nt		2.95	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	YFH1	YDL120W	525 nt		2.94	□□□□□ -1.94	RIP-Chip
NAB3	P38996	TIM9	YEL020W-A	264 nt		2.94	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	RPL30	YGL030W	318 nt		2.94	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	YIR020C-B	YIR020C-B	735 nt		2.94	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	GYP7	YDL234C	2241 nt		2.94	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	YEL043W	YEL043W	2871 nt		2.94	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	PFF1	YBR074W	2931 nt		2.93	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	SNT1	YCR033W	3681 nt		2.93	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	ESL1	YIL151C	3357 nt		2.93	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	NCS2	YNL119W	1482 nt		2.93	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	MRP10	YDL045W-A	288 nt		2.93	□□□□□ -1.94	RIP-Chip
NAB3	P38996	YBR197C	YBR197C	654 nt		2.93	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	OSW7	YFR039C	1533 nt		2.93	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	YRR1	YOR162C	2433 nt		2.92	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	VPS16	YPL045W	2397 nt		2.92	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	PBP4	YDL053C	558 nt		2.92	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	snR83	snR83	306 nt		2.92	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	COG2	YGR120C	789 nt		2.92	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	PEX18	YHR160C	852 nt		2.92	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	UTP30	YKR060W	825 nt		2.92	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	YGR067C	YGR067C	2415 nt		2.92	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	GDI1	YER136W	1356 nt		2.91	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	PAU10	YDR542W	363 nt		2.91	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	PAU11	YGL261C	363 nt		2.91	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	YIP1	YGR172C	747 nt		2.91	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	ILV5	YLR355C	1188 nt		2.91	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	PAU4	YLR461W	363 nt		2.91	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	TLC1	TLC1	1301 nt		2.91	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	ORC1	YML065W	2745 nt		2.91	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	YPR097W	YPR097W	3222 nt		2.9	□□□□□ -1.94
NAB3	P38996	UBP14	YBR058C	2346 nt		2.9	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	YCR099C	YCR099C	468 nt		2.9	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	YDR203W	YDR203W	318 nt		2.9	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	YGR109W-A	YGR109W-A	873 nt		2.9	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	YIL082W	YIL082W	873 nt		2.9	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	YLR154W-A	YLR154W-A	186 nt		2.9	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	YOL150C	YOL150C	312 nt		2.9	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	CIN8	YEL061C	3003 nt		2.9	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	KSP1	YHR082C	3090 nt		2.9	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	PRK1	YIL095W	2433 nt		2.9	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	YDR186C	YDR186C	2634 nt		2.89	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	TFC4	YGR047C	3078 nt		2.89	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	RRT13	YER066W	558 nt		2.89	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	SWM2	YNR004W	441 nt		2.89	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	ATP3	YBR039W	936 nt		2.89	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	NIP7	YPL211W	546 nt		2.89	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	YBR277C	YBR277C	402 nt		2.89	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	CEP3	YMR168C	1827 nt		2.89	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	UBR1	YGR184C	5853 nt		2.88	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	OPI6	YDL096C	327 nt		2.88	□□□□□ -1.95
NAB3	P38996	PGD1	YGL025C	1194 nt		2.88	□□□□□ -1.95

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