Protein–RNA interactions for Protein: P38871

SSP1, Sporulation-specific protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP1P38871 MPS3YJL019W 2049 nt6.01□□□□□ -1.45
SSP1P38871 YDR048CYDR048C 315 nt6.01□□□□□ -1.45
SSP1P38871 HTB2YBL002W 396 nt6.01□□□□□ -1.45
SSP1P38871 GAD1YMR250W 1758 nt6.01□□□□□ -1.45
SSP1P38871 MES1YGR264C 2256 nt6□□□□□ -1.45
SSP1P38871 ELP2YGR200C 2367 nt6□□□□□ -1.45
SSP1P38871 RLF2YPR018W 1821 nt6□□□□□ -1.45
SSP1P38871 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt6□□□□□ -1.45
SSP1P38871 RPL36BYPL249C-A 303 nt6□□□□□ -1.45
SSP1P38871 RDH54YBR073W 2877 nt6□□□□□ -1.45
SSP1P38871 BBC1YJL020C 3474 nt5.99□□□□□ -1.45
SSP1P38871 VPS41YDR080W 2979 nt5.99□□□□□ -1.45
SSP1P38871 MAL11YGR289C 1851 nt5.99□□□□□ -1.45
SSP1P38871 RPS0AYGR214W 759 nt5.99□□□□□ -1.45
SSP1P38871 ECM34YHL043W 513 nt5.99□□□□□ -1.45
SSP1P38871 VPS55YJR044C 423 nt5.99□□□□□ -1.45
SSP1P38871 RPS22BYLR367W 393 nt5.99□□□□□ -1.45
SSP1P38871 YHR078WYHR078W 1659 nt5.98□□□□□ -1.45
SSP1P38871 NAN1YPL126W 2691 nt5.98□□□□□ -1.45
SSP1P38871 SSH1YBR283C 1473 nt5.98□□□□□ -1.45
SSP1P38871 FRQ1YDR373W 573 nt5.98□□□□□ -1.45
SSP1P38871 PAN6YIL145C 930 nt5.98□□□□□ -1.45
SSP1P38871 RAD27YKL113C 1149 nt5.98□□□□□ -1.45
SSP1P38871 GDH2YDL215C 3279 nt5.97□□□□□ -1.45
SSP1P38871 RPS9AYPL081W 594 nt5.97□□□□□ -1.45
SSP1P38871 COX1Q0045 1605 nt5.96□□□□□ -1.45
SSP1P38871 YNL010WYNL010W 726 nt5.96□□□□□ -1.46
SSP1P38871 SSK22YCR073C 3996 nt5.96□□□□□ -1.46
SSP1P38871 RIM20YOR275C 1986 nt5.95□□□□□ -1.46
SSP1P38871 ARG5,6YER069W 2592 nt5.95□□□□□ -1.46
SSP1P38871 SHH3YMR118C 591 nt5.95□□□□□ -1.46
SSP1P38871 MSC7YHR039C 1935 nt5.95□□□□□ -1.46
SSP1P38871 CHL1YPL008W 2586 nt5.95□□□□□ -1.46
SSP1P38871 REV1YOR346W 2958 nt5.94□□□□□ -1.46
SSP1P38871 PAU2YEL049W 363 nt5.94□□□□□ -1.46
SSP1P38871 AMD1YML035C 2433 nt5.94□□□□□ -1.46
SSP1P38871 SBE2YDR351W 2595 nt5.93□□□□□ -1.46
SSP1P38871 NUP60YAR002W 1620 nt5.93□□□□□ -1.46
SSP1P38871 ECM25YJL201W 1800 nt5.93□□□□□ -1.46
SSP1P38871 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.93□□□□□ -1.46
SSP1P38871 YKR033CYKR033C 426 nt5.93□□□□□ -1.46
SSP1P38871 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.93□□□□□ -1.46
SSP1P38871 YBL109WYBL109W 336 nt5.93□□□□□ -1.46
SSP1P38871 PRM15YMR278W 1869 nt5.93□□□□□ -1.46
SSP1P38871 UBX7YBR273C 1311 nt5.93□□□□□ -1.46
SSP1P38871 YGR022CYGR022C 330 nt5.92□□□□□ -1.46
SSP1P38871 PAU13YHL046C 363 nt5.92□□□□□ -1.46
SSP1P38871 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt5.92□□□□□ -1.46
SSP1P38871 APC4YDR118W 1959 nt5.92□□□□□ -1.46
SSP1P38871 MNL1YHR204W 2391 nt5.92□□□□□ -1.46
SSP1P38871 ARG2YJL071W 1725 nt5.91□□□□□ -1.46
SSP1P38871 HSF1YGL073W 2502 nt5.91□□□□□ -1.46
SSP1P38871 SNZ2YNL333W 897 nt5.91□□□□□ -1.46
SSP1P38871 ALY1YKR021W 2748 nt5.9□□□□□ -1.46
SSP1P38871 EPS1YIL005W 2106 nt5.9□□□□□ -1.46
SSP1P38871 YRA1YDR381W 681 nt5.9□□□□□ -1.46
SSP1P38871 RIP1YEL024W 648 nt5.9□□□□□ -1.46
SSP1P38871 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.9□□□□□ -1.46
SSP1P38871 CCT7YJL111W 1653 nt5.9□□□□□ -1.47
SSP1P38871 CWH41YGL027C 2502 nt5.9□□□□□ -1.47
SSP1P38871 PHM7YOL084W 2976 nt5.9□□□□□ -1.47
SSP1P38871 RPS24AYER074W 408 nt5.89□□□□□ -1.47
SSP1P38871 RET1YOR207C 3450 nt5.89□□□□□ -1.47
SSP1P38871 SWD3YBR175W 948 nt5.88□□□□□ -1.47
SSP1P38871 KIN4YOR233W 2403 nt5.88□□□□□ -1.47
SSP1P38871 VTH1YIL173W 4650 nt5.88□□□□□ -1.47
SSP1P38871 VTH2YJL222W 4650 nt5.88□□□□□ -1.47
SSP1P38871 YER077CYER077C 2067 nt5.87□□□□□ -1.47
SSP1P38871 ACC1YNR016C 6702 nt5.87□□□□□ -1.47
SSP1P38871 LHP1YDL051W 828 nt5.87□□□□□ -1.47
SSP1P38871 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt5.87□□□□□ -1.47
SSP1P38871 CYB5YNL111C 363 nt5.87□□□□□ -1.47
SSP1P38871 YPL182CYPL182C 384 nt5.87□□□□□ -1.47
SSP1P38871 ALO1YML086C 1581 nt5.87□□□□□ -1.47
SSP1P38871 FRE3YOR381W 2136 nt5.86□□□□□ -1.47
SSP1P38871 PAU23YLR037C 375 nt5.86□□□□□ -1.47
SSP1P38871 RFC3YNL290W 1023 nt5.86□□□□□ -1.47
SSP1P38871 UBA1YKL210W 3075 nt5.86□□□□□ -1.47
SSP1P38871 AIM9YER080W 1884 nt5.85□□□□□ -1.47
SSP1P38871 OLI1Q0130 231 nt5.85□□□□□ -1.47
SSP1P38871 PEX11YOL147C 711 nt5.85□□□□□ -1.47
SSP1P38871 VPS70YJR126C 2436 nt5.84□□□□□ -1.47
SSP1P38871 RHO2YNL090W 579 nt5.84□□□□□ -1.47
SSP1P38871 YPL025CYPL025C 558 nt5.84□□□□□ -1.47
SSP1P38871 ISU1YPL135W 498 nt5.84□□□□□ -1.47
SSP1P38871 FRE8YLR047C 2061 nt5.83□□□□□ -1.48
SSP1P38871 ADP1YCR011C 3150 nt5.83□□□□□ -1.48
SSP1P38871 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt5.83□□□□□ -1.48
SSP1P38871 VTC1YER072W 390 nt5.83□□□□□ -1.48
SSP1P38871 YGR269WYGR269W 327 nt5.83□□□□□ -1.48
SSP1P38871 KIP2YPL155C 2121 nt5.83□□□□□ -1.48
SSP1P38871 SOK2YMR016C 2358 nt5.82□□□□□ -1.48
SSP1P38871 ALG8YOR067C 1734 nt5.82□□□□□ -1.48
SSP1P38871 TGL4YKR089C 2733 nt5.82□□□□□ -1.48
SSP1P38871 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt5.82□□□□□ -1.48
SSP1P38871 YLR053CYLR053C 327 nt5.82□□□□□ -1.48
SSP1P38871 YNL057WYNL057W 333 nt5.82□□□□□ -1.48
SSP1P38871 ATP15YPL271W 189 nt5.82□□□□□ -1.48
SSP1P38871 BUL1YMR275C 2931 nt5.82□□□□□ -1.48
SSP1P38871 ASK10YGR097W 3441 nt5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 86.5 ms