Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL4P36578 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL4P36578 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL4P36578 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL4P36578 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL4P36578 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL4P36578 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL4P36578 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL4P36578 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL4P36578 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL4P36578 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL4P36578 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL4P36578 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL4P36578 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL4P36578 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL4P36578 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL4P36578 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL4P36578 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL4P36578 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL4P36578 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL4P36578 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL4P36578 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL4P36578 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL4P36578 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL4P36578 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL4P36578 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL4P36578 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms