Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJC1P36383 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJC1P36383 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJC1P36383 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJC1P36383 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJC1P36383 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GJC1P36383 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJC1P36383 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJC1P36383 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GJC1P36383 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GJC1P36383 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJC1P36383 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJC1P36383 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJC1P36383 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
GJC1P36383 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJC1P36383 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms