Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOX11P35716 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOX11P35716 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SOX11P35716 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX11P35716 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX11P35716 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX11P35716 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX11P35716 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX11P35716 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SOX11P35716 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOX11P35716 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOX11P35716 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX11P35716 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX11P35716 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOX11P35716 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms