Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDXP35241 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDXP35241 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDXP35241 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDXP35241 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDXP35241 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDXP35241 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDXP35241 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDXP35241 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDXP35241 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDXP35241 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDXP35241 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDXP35241 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDXP35241 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDXP35241 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDXP35241 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms