Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCKSP29966 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCKSP29966 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCKSP29966 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCKSP29966 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCKSP29966 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCKSP29966 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms