Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD1P29536 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms