Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA3P26006 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms