Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR4P22455 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR4P22455 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms