Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC3P19447 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC3P19447 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms