Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN2P17655 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms