Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCFC2P16383 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCFC2P16383 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms