Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH1P12830 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH1P12830 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDH1P12830 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH1P12830 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH1P12830 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH1P12830 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH1P12830 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH1P12830 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH1P12830 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH1P12830 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH1P12830 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH1P12830 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDH1P12830 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH1P12830 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH1P12830 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH1P12830 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH1P12830 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDH1P12830 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms