Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC4P0CG21 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC4P0CG21 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC4P0CG21 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC4P0CG21 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC4P0CG21 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC4P0CG21 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC4P0CG21 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC4P0CG21 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NHLRC4P0CG21 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms