Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
USP19O94966 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP19O94966 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP19O94966 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP19O94966 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP19O94966 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP19O94966 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP19O94966 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP19O94966 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP19O94966 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP19O94966 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP19O94966 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP19O94966 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP19O94966 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP19O94966 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP19O94966 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP19O94966 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP19O94966 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP19O94966 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP19O94966 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP19O94966 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP19O94966 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP19O94966 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP19O94966 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP19O94966 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP19O94966 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP19O94966 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP19O94966 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP19O94966 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP19O94966 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP19O94966 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP19O94966 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP19O94966 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP19O94966 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP19O94966 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP19O94966 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP19O94966 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP19O94966 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP19O94966 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP19O94966 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP19O94966 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP19O94966 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP19O94966 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms