Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JtbO88824 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JtbO88824 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JtbO88824 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JtbO88824 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JtbO88824 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JtbO88824 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JtbO88824 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JtbO88824 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JtbO88824 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JtbO88824 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JtbO88824 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JtbO88824 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JtbO88824 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JtbO88824 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JtbO88824 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JtbO88824 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JtbO88824 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JtbO88824 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JtbO88824 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JtbO88824 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JtbO88824 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
JtbO88824 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms