Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRD4O60885 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRD4O60885 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BRD4O60885 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BRD4O60885 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRD4O60885 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD4O60885 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD4O60885 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD4O60885 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD4O60885 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD4O60885 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD4O60885 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD4O60885 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD4O60885 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD4O60885 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD4O60885 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRD4O60885 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD4O60885 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD4O60885 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD4O60885 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD4O60885 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD4O60885 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD4O60885 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD4O60885 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRD4O60885 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRD4O60885 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD4O60885 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD4O60885 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD4O60885 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD4O60885 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD4O60885 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD4O60885 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD4O60885 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD4O60885 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD4O60885 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD4O60885 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD4O60885 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRD4O60885 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD4O60885 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD4O60885 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD4O60885 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD4O60885 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD4O60885 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD4O60885 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD4O60885 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD4O60885 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRD4O60885 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRD4O60885 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRD4O60885 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRD4O60885 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRD4O60885 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRD4O60885 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRD4O60885 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRD4O60885 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRD4O60885 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRD4O60885 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms