Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH6O60337 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms