Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MSH5O43196 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSH5O43196 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSH5O43196 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSH5O43196 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSH5O43196 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSH5O43196 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSH5O43196 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSH5O43196 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSH5O43196 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MSH5O43196 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSH5O43196 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MSH5O43196 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSH5O43196 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MSH5O43196 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MSH5O43196 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSH5O43196 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSH5O43196 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSH5O43196 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSH5O43196 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSH5O43196 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSH5O43196 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MSH5O43196 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSH5O43196 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSH5O43196 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSH5O43196 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSH5O43196 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSH5O43196 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSH5O43196 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSH5O43196 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MSH5O43196 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSH5O43196 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSH5O43196 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSH5O43196 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSH5O43196 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSH5O43196 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSH5O43196 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSH5O43196 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSH5O43196 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MSH5O43196 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MSH5O43196 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MSH5O43196 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MSH5O43196 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSH5O43196 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSH5O43196 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSH5O43196 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSH5O43196 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSH5O43196 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSH5O43196 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSH5O43196 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MSH5O43196 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSH5O43196 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSH5O43196 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSH5O43196 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MSH5O43196 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSH5O43196 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSH5O43196 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MSH5O43196 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSH5O43196 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MSH5O43196 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSH5O43196 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSH5O43196 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSH5O43196 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSH5O43196 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSH5O43196 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSH5O43196 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MSH5O43196 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSH5O43196 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MSH5O43196 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MSH5O43196 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms