Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLRMTO00411 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLRMTO00411 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms