Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms