Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTL1A6NKG5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL1A6NKG5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RTL1A6NKG5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RTL1A6NKG5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTL1A6NKG5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTL1A6NKG5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RTL1A6NKG5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTL1A6NKG5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTL1A6NKG5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms