Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPDC1A2A3K4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms