Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC5DA1L4H1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSC5DA1L4H1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms