Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOD1Q9Y239 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NOD1Q9Y239 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms