Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNNA3Q9UI47 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTNNA3Q9UI47 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms