Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBEC3BQ9UH17 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms