Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DKK2Q9UBU2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms