Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms