Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
LRP2BPQ9P2M1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRP2BPQ9P2M1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms