Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SALL1Q9NSC2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SALL1Q9NSC2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms