Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNNM1Q9NRU3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms