Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2B1Q9NRF2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2B1Q9NRF2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms